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Confidence Calibration Graph Convolutional Networks (CAGCN)

Dataset Statics

Dataset # Nodes # Edges # Classes
Cora 2,708 10,556 7
Citeseer 3,327 9,228 6
Pubmed 19,717 88,651 3

Refer to Planetoid.

Results

## GCN L/C=20
TL_BACKEND="torch" python cagcn_trainer.py --hidden 64 --dataset Cora --labelrate 20 --stage 4 --lr_for_cal 0.001 --l2_for_cal 5e-3 --epoch_for_st 200 --threshold 0.8 --lr 0.005 --weight_decay 0.01 --dropout 0.8
TL_BACKEND="torch" python cagcn_trainer.py --model GCN --dataset Citeseer --stage 7 --epochs 2000 --epoch_for_st 200 --lr 0.01 --lr_for_cal 0.01 --weight_decay 0.0005 --l2_for_cal 0.005 --hidden 256 --dropout 0.8 --labelrate 20 --n_bins 20 --Lambda 0.5 --patience 100 --threshold 0.95
TL_BACKEND="torch" python cagcn_trainer.py --model GCN --hidden 64 --dataset Pubmed --labelrate 20 --stage 6 --lr_for_cal 0.001 --l2_for_cal 5e-3 --epoch_for_st 100 --threshold 0.8 --lr 0.01 --weight_decay 0.002 --dropout 0.5
TL_BACKEND="tensorflow" python cagcn_trainer.py --hidden 64 --dataset Cora --labelrate 20 --stage 4 --lr_for_cal 0.001 --l2_for_cal 5e-3 --epoch_for_st 200 --threshold 0.8 --lr 0.005 --weight_decay 0.01 --dropout 0.8 
TL_BACKEND="tensorflow" python cagcn_trainer.py --hidden 64 --dataset Citeseer --labelrate 20 --stage 5 --lr_for_cal 0.001 --l2_for_cal 5e-3 --epoch_for_st 150 --threshold 0.9 --lr 0.01 --weight_decay 0.01 --dropout 0.8 
TL_BACKEND="tensorflow" python cagcn_trainer.py --model GCN --hidden 64 --dataset Pubmed --labelrate 20 --stage 6 --lr_for_cal 0.001 --l2_for_cal 5e-3 --epoch_for_st 100 --threshold 0.8 --lr 0.01 --weight_decay 0.002 --dropout 0.5
TL_BACKEND="paddle" python cagcn_trainer.py --hidden 64 --dataset Cora --labelrate 20 --stage 4 --lr_for_cal 0.001 --l2_for_cal 5e-3 --epoch_for_st 200 --threshold 0.8 --lr 0.005 --weight_decay 0.01 --dropout 0.8
TL_BACKEND="paddle" python cagcn_trainer.py --model GCN --dataset Citeseer --stage 7 --epochs 2000 --epoch_for_st 200 --lr 0.01 --lr_for_cal 0.01 --weight_decay 0.0005 --l2_for_cal 0.005 --hidden 256 --dropout 0.8 --labelrate 20 --n_bins 20 --Lambda 0.5 --patience 100 --threshold 0.95
TL_BACKEND="paddle" python cagcn_trainer.py --model GCN --hidden 64 --dataset Pubmed --labelrate 20 --stage 6 --lr_for_cal 0.001 --l2_for_cal 5e-3 --epoch_for_st 100 --threshold 0.8 --lr 0.01 --weight_decay 0.002 --dropout 0.5

## GCN L/C=40
TL_BACKEND="torch" python cagcn_trainer.py --model GCN --hidden 64 --dataset Cora --labelrate 40 --stage 2 --lr_for_cal 0.001 --l2_for_cal 5e-4 --epoch_for_st 200 --threshold 0.8 --lr 0.005 --weight_decay 0.01 --dropout 0.8
TL_BACKEND="torch" python cagcn_trainer.py --model GCN --dataset Citeseer --stage 4 --epochs 2000 --epoch_for_st 200 --lr 0.05 --lr_for_cal 0.05 --weight_decay 0.05 --l2_for_cal 0.005 --hidden 256 --dropout 0.5 --labelrate 40 --n_bins 20 --Lambda 0.5 --patience 100 --threshold 0.9 
TL_BACKEND="torch" python cagcn_trainer.py --model GCN --hidden 64 --dataset Pubmed --labelrate 40 --stage 4 --lr_for_cal 0.001 --l2_for_cal 5e-3 --epoch_for_st 100 --threshold 0.8 --lr 0.01 --weight_decay 0.002 --dropout 0.5 
TL_BACKEND="tensorflow" python cagcn_trainer.py --model GCN --hidden 64 --dataset Cora --labelrate 40 --stage 2 --lr_for_cal 0.001 --l2_for_cal 5e-3 --epoch_for_st 200 --threshold 0.8  --lr 0.005 --weight_decay 0.01 --dropout 0.8 
TL_BACKEND="tensorflow" python cagcn_trainer.py --hidden 64 --dataset Citeseer --labelrate 40 --stage 5 --lr_for_cal 0.001 --l2_for_cal 5e-4 --epoch_for_st 150 --threshold 0.95 --lr 0.01 --weight_decay 0.01 --dropout 0.8
TL_BACKEND="tensorflow" python cagcn_trainer.py --model GCN --hidden 64 --dataset Pubmed --labelrate 40 --stage 4 --lr_for_cal 0.001 --l2_for_cal 5e-3 --epoch_for_st 100 --threshold 0.8  --lr 0.01 --weight_decay 0.001 --dropout 0.9
TL_BACKEND="paddle" python cagcn_trainer.py --model GCN --hidden 64 --dataset Cora --labelrate 40 --stage 2 --lr_for_cal 0.001 --l2_for_cal 5e-4 --epoch_for_st 200 --threshold 0.8 --lr 0.005 --weight_decay 0.01 --dropout 0.8
TL_BACKEND="paddle" python cagcn_trainer.py --model GCN --dataset Citeseer --stage 4 --epochs 2000 --epoch_for_st 200 --lr 0.05 --lr_for_cal 0.05 --weight_decay 0.05 --l2_for_cal 0.005 --hidden 256 --dropout 0.5 --labelrate 40 --n_bins 20 --Lambda 0.5 --patience 100 --threshold 0.9
TL_BACKEND="paddle" python cagcn_trainer.py --model GCN --dataset Pubmed --stage 4 --epochs 2000 --epoch_for_st 100 --lr 0.01 --lr_for_cal 0.001 --weight_decay 0.001 --l2_for_cal 0.005 --hidden 64 --dropout 0.9 --labelrate 40 --n_bins 20 --Lambda 0.5 --patience 100 --threshold 0.8


## GCN L/C=60
TL_BACKEND="torch" python cagcn_trainer.py --model GCN --hidden 64 --dataset Cora --labelrate 60 --stage 4 --lr_for_cal 0.001 --l2_for_cal 5e-3 --epoch_for_st 200 --threshold 0.8 --lr 0.005 --weight_decay 0.01 --dropout 0.8
TL_BACKEND="torch" python cagcn_trainer.py --model GCN --hidden 64 --dataset Citeseer --labelrate 60 --stage 6 --lr_for_cal 0.001 --l2_for_cal 5e-3 --epoch_for_st 100 --threshold 0.99 --lr 0.01 --weight_decay 0.01 --dropout 0.7
TL_BACKEND="torch" python cagcn_trainer.py --model GCN --hidden 64 --dataset Pubmed --labelrate 60 --stage 3 --lr_for_cal 0.001 --l2_for_cal 5e-3 --epoch_for_st 100 --threshold 0.6 --lr 0.01 --weight_decay 0.002 --dropout 0.5
TL_BACKEND="tensorflow" python cagcn_trainer.py --model GCN --hidden 64 --dataset Cora --labelrate 60 --stage 4 --lr_for_cal 0.001 --l2_for_cal 5e-3 --epoch_for_st 200 --threshold 0.8 --lr 0.005 --weight_decay 0.01 --dropout 0.8
TL_BACKEND="tensorflow" python cagcn_trainer.py --model GCN --hidden 64 --dataset Citeseer --labelrate 60 --stage 6 --lr_for_cal 0.001 --l2_for_cal 5e-3 --epoch_for_st 100 --threshold 0.99 --lr 0.01 --weight_decay 0.01 --dropout 0.8
TL_BACKEND="tensorflow" python cagcn_trainer.py --model GCN --hidden 64 --dataset Pubmed --labelrate 60 --stage 3 --lr_for_cal 0.001 --l2_for_cal 5e-3 --epoch_for_st 100 --threshold 0.6  --lr 0.01 --weight_decay 0.001 --dropout 0.9
TL_BACKEND="paddle" python cagcn_trainer.py --model GCN --hidden 64 --dataset Cora --labelrate 60 --stage 4 --lr_for_cal 0.001 --l2_for_cal 5e-3 --epoch_for_st 200 --threshold 0.8 --lr 0.005 --weight_decay 0.01 --dropout 0.8
TL_BACKEND="paddle" python cagcn_trainer.py --model GCN --hidden 64 --dataset Citeseer --labelrate 60 --stage 6 --lr_for_cal 0.001 --l2_for_cal 5e-3 --epoch_for_st 100 --threshold 0.99 --lr 0.01 --weight_decay 0.01 --dropout 0.7
TL_BACKEND="paddle" python cagcn_trainer.py --model GCN --dataset Pubmed --stage 3 --epochs 2000 --epoch_for_st 100 --lr 0.01 --lr_for_cal 0.001 --weight_decay 0.001 --l2_for_cal 0.005 --hidden 64 --dropout 0.9 --labelrate 60 --n_bins 20 --Lambda 0.5 --patience 100 --threshold 0.6
Dataset L/C Paper Our(torch) Our(tensorflow) Our(paddle)
cora 20 83.11±0.52 83.23(±0.43) 83.39(±0.45) 79.86(±1.14)
cora 40 84.37±0.38 83.53(±0.63) 83.73(±0.75) 84.42(±0.37)
cora 60 85.79±0.27 85.23(±0.56) 84.07(±1.10) 85.22(±0.62)
citeseer 20 74.90±0.40 72.03(±0.68) 83.63(±0.34) 71.34(±0.91)
citeseer 40 75.48±0.50 72.63(±0.33) 84.08(±0.62) 72.04(±0.48)
citeseer 60 76.43±0.20 72.65(±0.68) 84.86(±0.55) 72.46(±1.07)
pubmed 20 81.16±0.36 78.13(±0.46) 82.60(±0.64) 78.24(±0.76)
pubmed 40 83.08±0.21 78.67(±1.14) 83.46(±1.23) 78.81(±0.99)
pubmed 60 84.47±0.23 79.67(±1.52) 85.28(±0.41) 79.96(±0.54)