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R入門いろはにほへと: インストールから簡単な操作まで

author: 瓜生真也（横浜国立大学大学院環境情報学府） date: June 30, 2014 font-family: 'Helvetica' autosize: true css: custom.css

CONTENTS

1. Rの概要
2. Rのインストール
3. 簡単な操作
4. RStudioのインストール

Rの概要

多くの研究分野で使用される統計解析環境ソフト

• オープンソースなので、どういう機能を持っているのかがわかりやすい
• フリーソフトウェア。他の統計解析ソフトの多くが高価
• パッケージと呼ばれる拡張機能により、多くの機能を増やせる

Rのインストール

-> CRAN

Downlaod R for Linux/Mac/Win

Windowsの場合...

Rスクリプトの書き方

1 + 3

[1] 4

a <- c(1, 2, 3)
a

[1] 1 2 3

b <- c(4, 5, 6)
a + b

[1] 5 7 9

a * b

[1]  4 10 18

Rスクリプトの書き方

mean(b)

[1] 5

10 * pi

[1] 31.42

Andersonのアヤメのデータを使った例

三種類のあやめの品種のそれぞれからの50の花の蕚(がく)片の長さと幅、花弁の長さと幅

data(iris)
head(iris)

  Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length Petal.Width Species
1          5.1         3.5          1.4         0.2  setosa
2          4.9         3.0          1.4         0.2  setosa
3          4.7         3.2          1.3         0.2  setosa
4          4.6         3.1          1.5         0.2  setosa
5          5.0         3.6          1.4         0.2  setosa
6          5.4         3.9          1.7         0.4  setosa

Fisherのアヤメのデータを使った例

図を描く

plot(
  iris$Sepal.Length, iris$Petal.Length, 
  col=c("royal blue", "green", "orange")[iris$Species], 
  pch=16, cex=2)

関数とパッケージ

一元配置分散分析... oneway.test()

３種の萼片の長さの平均値に差があるか

oneway.test(iris$Sepal.Length ~ iris$Specie)

	One-way analysis of means (not assuming equal variances)

data:  iris$Sepal.Length and iris$Specie
F = 138.9, num df = 2.00, denom df = 92.21, p-value < 2.2e-16

P < 0.001で萼片の長さの平均値には３種間で差がある

関数とパッケージ

install.package("lattice", dependencies=TRUE)

library(lattice)
xyplot(
  Petal.Length ~ Sepal.Length | Species,
  data=iris)

RStudioのインストール

http://www.rstudio.com

RStudioのインストール