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"""
Desarrollado por Johanny Vargas González
28/08/2017
"""
import numpy as np
import pandas as pd
import matplotlib.pyplot as plt
import math, operator, random, copy, os
from numpy import linalg as la
# Función que retorna la variable con el nombre de la carpeta de dataset
def folder():
carpeta = 'dataset/'
return carpeta
# Función que retorna una lista con los archivos del dataset
def files(carpeta):
archivos = os.listdir(carpeta)
return archivos
# Función que selecciona el archivo
def seleccionar():
print()
archivos = files(folder())
for x in range(len(archivos)):
print(str(x+1) + ". " + archivos[x])
nArchivo = int(input("Ingrese el número del dataset que desea seleccionar: "))
while (nArchivo < 1 or nArchivo > len(archivos)):
nArchivo = int(input("El número es incorrecto, debe estar entre " + str(1) + " y " + str(len(archivos)) + ": "))
return archivos[nArchivo-1]
# Función que carga el archivo y pregunta si tiene encabezado
def loadDataset():
header = input("\nEl archivo tiene encabezado? y/n: ")
header = header.lower()
if header == 'y' or header == 'yes' or header == 's' or header == 'si':
header = 0
else:
header = None
print("El archivo debe de tener encabezado para determinar las caracteristicas y las clases")
exit()
dataset = pd.read_csv(str(folder()) + str(seleccionar()), header=header)
return dataset
# Función que recibe que n individuo de la matriz normalizada va a devolver
def vector_registro_matrizNormalizada(n, matrizNormalizada, columns):
registro_matrizNormalizada = list()
for i in range(columns):
valor = matrizNormalizada[n][i]
registro_matrizNormalizada.append(valor)
return registro_matrizNormalizada
# Función de la distancia euclidiana
def dist_euclidiana(v1, v2):
dimension = len(v1)
suma = 0
for i in range(dimension):
suma += math.pow(float(v1[i]) - float(v2[i]), 2)
return math.sqrt(suma)
# Función de la distancia de manhattan
def dist_manhattan(v1, v2):
dimension = len(v1)
resutl = 0
rest = 0
for x in range(dimension):
rest += (float(v1[x]) - float(v2[x]))
result = abs(rest)
return result
# Función que determina el numero menor de unal ista y devuelve su posición
def minimo(lista):
dimension = len(lista)
minimo = lista[0]
posicion = 0
for x in range(1, dimension):
if (minimo > lista[x]):
minimo = lista[x]
posicion = x
return posicion
# Lista de metricas de distancia
lista_metricas = ['Distancia euclidiana', 'Distancia de manhattan']
# Función que selecciona la metrica que se quiere
def seleccion_metrica():
print()
for x in range(len(lista_metricas)):
print(str(x+1) + ". " + str(lista_metricas[x]))
mOpcion = int(input("Seleccione la metrica que quiere utilizar: "))
while (mOpcion < 1 or mOpcion > len(lista_metricas)):
mOpcion = int(input("El número es incorrecto, debe estar entre " + str(1) + " y " + str(len(lista_metricas)) + ": "))
return mOpcion
# Función que escoge la metrica que se quiere
def seleccion_metrica_distancia(v1, v2, mOpcion):
if (mOpcion == 1):
resultado = dist_euclidiana(v1, v2) # Distancia euclidiana
elif (mOpcion == 2):
resultado = dist_manhattan(v1, v2) # Distancia de manhattan
return resultado
# ALGORITMOS DE ANÁLISIS DE COMPONENTES Y CLUSTERING
# =======================================================================================================================
# =======================================================================================================================
def ACP():
print("Algoritmo de ACP")
# Cargar el archivo dataset
dataset = loadDataset()
#print(dataset)
#print(dataset.head())
# Se extraen las columnas del dataset
dataset.columns
#print(dataset.columns)
print("Descripción del dataset: ")
print(dataset.describe()) # Descripción estadistica de los datos
columns = len(dataset.columns) # Número total de columnas
#print(columns)
rows = len(dataset.index) # Número total de filas
#print(rows)
# Agrupando columnas por tipo de datos
tipos = dataset.columns.to_series().groupby(dataset.dtypes).groups
# Armando lista de columnas categóricas
try:
ctext = tipos[np.dtype('object')]
except KeyError:
ctext = list() # lista de columnas vacia en caso de que no haya categóricas
print("\nNúmero de columnas categoricas: " + str(len(ctext))) # cantidad de columnas con datos categóricos
# Armando lista de columnas numéricas
columnas = dataset.columns # lista total las columnas
cnum = list(set(columnas) - set(ctext)) # Total de columnas menos columnas no numéricas
print("Número de columnas numericas: " + str(len(cnum)))
# Lista de medias
#print(dataset.mean())
'''media = list()
for x in range(len(dataset.mean())):
media.append(dataset.mean()[x])
print(media)'''
media = dataset.mean().values.tolist() # Convertir la media del dataset a una lista
print("\nLista de medias: " + str(media))
#print(media)
# Lista de desviación estandar
#print(dataset.std())
'''destandar = list()
for x in range(len(dataset.std())):
destandar.append(dataset.std()[x])
print(destandar)'''
destandar = dataset.std().values.tolist() # Convertir la desviación estandar del dataset a una lista
print("Lista de desviación estandar: " + str(destandar))
#print(destandar)
# Lista de caracteristicas
lcaracteristicas = list()
for x in range(len(cnum)):
lcaracteristicas.append(columnas[x])
print("Lista de características: " + str(lcaracteristicas))
#print(lcaracteristicas)
# Todas las filas y todas las columnas del dataset en una lista
matriz = dataset.loc[:,].values
print("\nMatriz:")
print(matriz)
# ===========================================================================================================================
# Datos ajustados de la matriz
matrizDatosAjustados = list()
MDArow = list()
for x in range(rows):
for y in range(len(cnum)):
result = (matriz[x][y] - media[y])
MDArow.append(result)
matrizDatosAjustados.append(MDArow)
MDArow = list()
print("\nMatriz de datos ajustados:")
#print(matrizDatosAjustados)
MDA = pd.DataFrame(np.array(matrizDatosAjustados)) # Matriz de datos ajustados con pandas
print(MDA)
# Transpuesta de la matriz de datos ajustados
Transpuesta = np.array(matrizDatosAjustados) # Convertir la lista a formato numpy
matrizDatosAjustadosT = Transpuesta.transpose().tolist() # Convertir la lista numpy con la transpuesta a formato normal de lista
print("\nMatriz de datos ajustados transpuesta:")
#print(matrizDatosAjustadosT)
MDAT = pd.DataFrame(np.array(matrizDatosAjustadosT)) # Matriz de datos ajustados con pandas
print(MDAT)
# Matriz de covarianza (Transpuesta X Datos-Ajustados)
matrizCovarianza = list()
MCrow = list()
suma = 0
for i in range(len(matrizDatosAjustadosT)): # Filas de la matriz 1
for j in range(len(cnum)): # Columnas de la matriz 2
for k in range(rows): # Filas de la matriz 2
suma += (matrizDatosAjustadosT[i][k] * matrizDatosAjustados[k][j])
covarianza = (suma / (rows-1)) # Cada valor de la matriz de covarianza se debe dividir por n-1 (filas-1)
MCrow.append(covarianza)
suma = 0
matrizCovarianza.append(MCrow)
MCrow = list()
print("\nMatriz de covarianza:")
#print(matrizCovarianza)
MC = pd.DataFrame(np.array(matrizCovarianza)) # Matriz de covarianza con pandas
print(MC)
# Valores propios y vectores propios
evalues, evectors = la.eig(np.array(matrizCovarianza))
print("\nValores propios:")
eigenvalues = evalues.tolist()
print(eigenvalues)
print("\nVectores propios:")
print(evectors)
eigenvectors = evectors.tolist()
#print(eigenvectors)
# Suma de los valores propios
sumaEigenvalues = 0
for x in range(len(eigenvalues)):
sumaEigenvalues += eigenvalues[x]
print("\nSuma de los valores propios: " + str(sumaEigenvalues))
# Importancia de las columnas en pocentajes
porcentaje = list()
for x in range(len(eigenvalues)):
result = (eigenvalues[x] / sumaEigenvalues) * 100
porcentaje.append(result)
print("\nImportancia de las columnas en porcentaje: " + str(porcentaje))
# Indices de los porcentajes
indicesPorcentajes = list()
for x in range(len(porcentaje)):
indicesPorcentajes.append(x)
# Diccionario de indices: porcentajes
diccionarioPorcentaje = dict(zip(indicesPorcentajes, porcentaje))
dp = sorted(diccionarioPorcentaje.items(), key=operator.itemgetter(1)) # Ordena el diccionario en tuplas por el valor (0 = clave, 1 = valor)
print("\nDiccionario columna:porcentaje ordenado por porcentaje (descendente):")
dp.reverse() # ordena descendente con .reverse()
print(dp) # Imprime el diccionario en tuplas ordenado por valor
# Nuevo conjunto de datos (Datos ajustados con la media X Matriz de vectores propios)
nuevoConjuntoDatos = list()
NCDrow = list()
suma = 0
for i in range(len(matrizDatosAjustados)): # Filas de la matriz 1
for j in range(len(eigenvectors)): # Columnas de la matriz 2
for k in range(len(eigenvectors)): # Filas de la matriz 2
suma += (matrizDatosAjustados[i][k] * eigenvectors[k][j])
NCDrow.append(suma)
suma = 0
nuevoConjuntoDatos.append(NCDrow)
NCDrow = list()
print("\nMatriz de nuevo conjunto de datos:")
#print(nuevoConjuntoDatos)
NCD = pd.DataFrame(np.array(nuevoConjuntoDatos)) # Matriz de nuevo conjunto de datos con pandas
print(NCD)
# Guardar componentes en un archivo csv
NCD.columns = lcaracteristicas
name = str(input("\nIngrese el nombre de su archivo .csv: "))
NCD.to_csv(str(folder()) + str(name) + '.csv', header=True, sep=',', index=False)
print("\nSe ha generado un archivo " + str(name) + ".csv con los componentes")
def ACPK():
print("Algoritmo de ACPK")
# Cargar el archivo dataset
dataset = loadDataset()
#print(dataset)
#print(dataset.head())
# Se extraen las columnas del dataset
dataset.columns
#print(dataset.columns)
print("Descripción del dataset: ")
print(dataset.describe()) # Descripción estadistica de los datos
columns = len(dataset.columns) # Número total de columnas
#print(columns)
rows = len(dataset.index) # Número total de filas
#print(rows)
# Agrupando columnas por tipo de datos
tipos = dataset.columns.to_series().groupby(dataset.dtypes).groups
# Armando lista de columnas categóricas
try:
ctext = tipos[np.dtype('object')]
except KeyError:
ctext = list() # lista de columnas vacia en caso de que no haya categóricas
print("\nNúmero de columnas categoricas: " + str(len(ctext))) # cantidad de columnas con datos categóricos
# Armando lista de columnas numéricas
columnas = dataset.columns # lista total las columnas
cnum = list(set(columnas) - set(ctext)) # Total de columnas menos columnas no numéricas
print("Número de columnas numericas: " + str(len(cnum)))
# Lista de medias
#print(dataset.mean())
'''media = list()
for x in range(len(dataset.mean())):
media.append(dataset.mean()[x])
print(media)'''
media = dataset.mean().values.tolist() # Convertir la media del dataset a una lista
print("\nLista de medias: " + str(media))
#print(media)
# Lista de desviación estandar
#print(dataset.std())
'''destandar = list()
for x in range(len(dataset.std())):
destandar.append(dataset.std()[x])
print(destandar)'''
destandar = dataset.std().values.tolist() # Convertir la desviación estandar del dataset a una lista
print("Lista de desviación estandar: " + str(destandar))
#print(destandar)
# Lista de caracteristicas
lcaracteristicas = list()
for x in range(len(cnum)):
lcaracteristicas.append(columnas[x])
print("Lista de características: " + str(lcaracteristicas))
#print(lcaracteristicas)
# Todas las filas y todas las columnas del dataset en una lista
matriz = dataset.loc[:,].values
print("\nMatriz:")
print(matriz)
# ===========================================================================================================================
# Datos de la matriz
matrizDatos = list()
MDrow = list()
for x in range(rows):
for y in range(len(cnum)):
result = (matriz[x][y])
MDrow.append(result)
matrizDatos.append(MDrow)
MDrow = list()
print("\nMatriz de datos:")
#print(matrizDatos)
MD = pd.DataFrame(np.array(matrizDatos)) # Matriz de datos con pandas
print(MD)
# Transpuesta de la matriz de datos
Transpuesta = np.array(matrizDatos) # Convertir la lista a formato numpy
matrizDatosT = Transpuesta.transpose().tolist() # Convertir la lista numpy con la transpuesta a formato normal de lista
print("\nMatriz transpuesta:")
#print(matrizDatosT)
MDT = pd.DataFrame(np.array(matrizDatosT)) # Matriz de datos con pandas
print(MDT)
# Matriz de covarianza (Transpuesta X Matriz)
matrizCovarianza = list()
MCrow = list()
suma = 0
for i in range(len(matrizDatosT)): # Filas de la matriz 1
for j in range(len(cnum)): # Columnas de la matriz 2
for k in range(rows): # Filas de la matriz 2
suma += (matrizDatosT[i][k] * matrizDatos[k][j])
covarianza = (suma / (rows-1)) # Cada valor de la matriz de covarianza se debe dividir por n-1 (filas-1)
MCrow.append(covarianza)
suma = 0
matrizCovarianza.append(MCrow)
MCrow = list()
print("\nMatriz de covarianza:")
#print(matrizCovarianza)
MC = pd.DataFrame(np.array(matrizCovarianza)) # Matriz de covarianza con pandas
print(MC)
# Valores propios y vectores propios
evalues, evectors = la.eig(np.array(matrizCovarianza))
print("\nValores propios:")
eigenvalues = evalues.tolist()
print(eigenvalues)
print("\nVectores propios:")
print(evectors)
eigenvectors = evectors.tolist()
#print(eigenvectors)
# Suma de los valores propios
sumaEigenvalues = 0
for x in range(len(eigenvalues)):
sumaEigenvalues += eigenvalues[x]
print("\nSuma de los valores propios: " + str(sumaEigenvalues))
# Multiplicación de la matriz de datos por la matriz de vectores propios (Matriz de datos X Vectores propios)
matrizNueva = list()
MNrow = list()
suma = 0
for i in range(len(matrizDatos)): # Filas de la matriz 1
for j in range(len(eigenvectors)): # Columnas de la matriz 2
for k in range(len(eigenvectors)): # Filas de la matriz 2
suma += (matrizDatos[i][k] * eigenvectors[k][j])
MNrow.append(suma)
suma = 0
matrizNueva.append(MNrow)
MNrow = list()
print("\nMatriz de nueva:")
#print(matrizNueva)
MN = pd.DataFrame(np.array(matrizNueva)) # Matriz de nueva con pandas
print(MN)
# Guardar componentes en un archivo csv
MN.columns = lcaracteristicas
name = str(input("\nIngrese el nombre de su archivo .csv: "))
MN.to_csv(str(folder()) + str(name) + '.csv', header=True, sep=',', index=False)
print("\nSe ha generado un archivo " + str(name) + ".csv con los componentes")
def KNN():
print("Algoritmo de KNN")
# Se establece la selección de la metrica que se quiere
opcionMetrica = seleccion_metrica()
# Cargar el archivo dataset
dataset = loadDataset()
#print(dataset)
#print(dataset.head())
# Se extraen las columnas del dataset
dataset.columns
#print(dataset.columns)
print("Descripción del dataset: ")
print(dataset.describe()) # Descripción estadistica de los datos
columns = len(dataset.columns) # Número total de columnas
#print(columns)
rows = len(dataset.index) # Número total de filas
#print(rows)
# Agrupando columnas por tipo de datos
tipos = dataset.columns.to_series().groupby(dataset.dtypes).groups
# Armando lista de columnas categóricas
try:
ctext = tipos[np.dtype('object')]
except KeyError:
ctext = list() # lista de columnas vacia en caso de que no haya categóricas
print("\nNúmero de columnas categoricas: " + str(len(ctext))) # cantidad de columnas con datos categóricos
# Armando lista de columnas numéricas
columnas = dataset.columns # lista total las columnas
cnum = list(set(columnas) - set(ctext)) # Total de columnas menos columnas no numéricas
print("Número de columnas numericas: " + str(len(cnum)))
# Lista de medias
#print(dataset.mean())
'''media = list()
for x in range(len(dataset.mean())):
media.append(dataset.mean()[x])
print(media)'''
media = dataset.mean().values.tolist() # Convertir la media del dataset a una lista
print("\nLista de medias: " + str(media))
#print(media)
# Lista de desviación estandar
#print(dataset.std())
'''destandar = list()
for x in range(len(dataset.std())):
destandar.append(dataset.std()[x])
print(destandar)'''
destandar = dataset.std().values.tolist() # Convertir la desviación estandar del dataset a una lista
print("Lista de desviación estandar: " + str(destandar))
#print(destandar)
# Lista de caracteristicas
lcaracteristicas = list()
for x in range(len(cnum)):
lcaracteristicas.append(columnas[x])
print("Lista de características: " + str(lcaracteristicas))
#print(lcaracteristicas)
# Todas las filas y todas las columnas del dataset en una lista
matriz = dataset.loc[:,].values
print("\nMatriz:")
print(matriz)
# Matriz normalizada
matrizNormalizada = list()
MNrow = list()
for x in range(rows):
for y in range(len(cnum)):
result = ((matriz[x][y] - media[y]) / destandar[y])
MNrow.append(result)
matrizNormalizada.append(MNrow)
MNrow = list()
print("\nMatriz normalizada:")
#print(matrizNormalizada) # Matriz con los valores normalizados de los Clusters
MN = pd.DataFrame(np.array(matrizNormalizada)) # Matriz normalizada con pandas
print(MN)
# Matriz de distancia euclidiana
individuo_tabla = list()
lista_metrica = list()
matriz_distancia = list()
for n in range(rows):
individuo = vector_registro_matrizNormalizada(n, matrizNormalizada, len(cnum))
#print(individuo)
for v in range(rows):
for h in range(len(cnum)):
valor = matrizNormalizada[v][h]
individuo_tabla.append(valor)
#print(individuo_tabla)
metrica = seleccion_metrica_distancia(individuo, individuo_tabla, opcionMetrica)
#print(metrica)
lista_metrica.append(metrica)
individuo_tabla = list()
#print(lista_metrica)
matriz_distancia.append(lista_metrica)
lista_metrica = list()
print("\nMatriz de " + str(lista_metricas[opcionMetrica-1]) + ": ")
#print(matriz_distancia)
MD = pd.DataFrame(np.array(matriz_distancia)) # Matriz de distacia con pandas
print(MD)
'''
# Matriz de distancia euclidiana, triangular inferior
triangular_inferior = copy.deepcopy(matriz_distancia) # Copia de la lista
TIrow = list()
for x in range(0,len(triangular_inferior)):
for y in range(x,len(triangular_inferior)):
triangular_inferior[x][y] = 0
print("\nMatriz de distancia euclidiana triangular inferior:")
#print(triangular_inferior)
TI = pd.DataFrame(np.array(triangular_inferior)) # Matriz de distacia triangular inferior con pandas
print(TI)
'''
# Selección de las características para el gráfico
print()
for x in range(len(lcaracteristicas)):
print(str(x+1) + ". " + lcaracteristicas[x])
print("Seleccione dos características para el gráfico de Cluster: ")
# Lista de las caracteristicas seleccionadas
listaGrafica = list()
etiquetasGrafica = list()
for x in range(2):
nCluster = int(input("Característica " + str(x+1) + ": "))
listaGrafica.append(nCluster-1) # Se seleccionan las caracteristicas de la lista de acuerdo al numero ingresado
etiquetasGrafica.append(lcaracteristicas[nCluster-1]) # Etiquetas de los ejes de la gráfica, las características seleccionadas
print("Ejes de la gráfica: " + str(listaGrafica)) # Lista de ejes para la gráfica
print("Etiquetas de la gráfica: " + str(etiquetasGrafica))
# Todas las filas y dos columnas para la gráfica
matrizGrafica = MN.ix[:, [listaGrafica[0], listaGrafica[1]]].values
print("\nMatriz de la gráfica:")
print(matrizGrafica)
# =============================================================================================================================
# Número de vecinos cercanos
k = int(input("\nIngrese el número de K o vecinos cercanos: "))
while (k < 1 or k > rows):
k = int(input("El valor de K es incorrecto, debe estar entre 1" + " y " + str(rows) + ": "))
# Valor seleccionado aleatoriamente para ser el Cluster
aleatorio = random.randint(0, rows-1)
print("Valor seleccionado aleatoriamente: " + str(aleatorio))
# Lista de distancias con respecto al Cluster seleccionado
valorDistancias = matriz_distancia[aleatorio]
print("\nDistancias al punto del Cluster:")
print(valorDistancias)
# Lista de indices
indices = list()
for x in range(len(valorDistancias)):
indices.append(x)
# Diccionario de indices: valorDistancias
diccionario = dict(zip(indices, valorDistancias))
d = sorted(diccionario.items(), key=operator.itemgetter(1)) # Ordena el diccionario en tuplas por el valor (0 = clave, 1 = valor)
print("\nDiccionario vecino:ditancia ordenado por distancia:")
print(d) # Imprime el diccionario en tuplas ordenado por valor
# Llaves y valores en listas
llaves = list()
valores = list()
for x in range(len(diccionario)):
llaves.append(d[x][0])
valores.append(d[x][1])
#print(llaves)
#print(valores)
# k vecinos más cercanos con el nuevo dato, ejes X y Y
knnDistancia = list()
knnDatos = list()
for x in range(k):
#print(str(llaves[x]) + " " + str(valores[x])) # Vecino (indice) y su distancia
#print(matrizNormalizada[llaves[x]]) # Datos de los vecinos más cercanos
knnDistancia.append([llaves[x], valores[x]]) # Lista del vecino más cercano con su distancia
knnDatos.append(matrizNormalizada[llaves[x]]) # Lista de los datos de los vecinos más cercanos
print("\nMatriz de vecinos más cercano con su distancia:")
#print(knnDistancia)
print(pd.DataFrame(np.array(knnDistancia))) # Matriz de vecinos más cercano con su distancia
print("\nMatriz de los datos de los vecinos más cercanos:")
#print(knnDatos)
print(pd.DataFrame(np.array(knnDatos))) # Matriz de los datos de los vecinos más cercanos
'''
# Listas de los ejes X y Y de Knn # Otra forma de hacerlo
kEjeX = list()
kEjeY = list()
for x in range(k):
kEjeX.append(knnDatos[x][0])
kEjeY.append(knnDatos[x][1])
print(kEjeX) # Eje X de los datos vecinos más cercanos
print(kEjeY) # Eje Y de los datos vecinos más cercanos
# Listas de los ejes X y Y # Otra forma de hacerlo
ejeX = list()
ejeY = list()
for x in range(len(matrizNormalizada)):
ejeX.append(matrizNormalizada[x][0])
ejeY.append(matrizNormalizada[x][1])
print(ejeX)
print(ejeY)
'''
# DataFrame con pandas de los ejes X y Y de la matriz normalizada
ejes = pd.DataFrame(np.array(matrizGrafica))
ejeX = ejes.ix[:, 0]
ejeY = ejes.ix[:, 1]
# DataFrame con pandas de los ejes X y Y de la matriz de vecinos más cercanos
KNND = pd.DataFrame(np.array(knnDatos)) # Se convierte la lista de datos de vecinos más cercanos a DataFrame
matrizGrafica = KNND.ix[:, [listaGrafica[0], listaGrafica[1]]].values # Lista de los ejes que se escogieron de vecinos más cercanos
kEjes = pd.DataFrame(np.array(matrizGrafica))
kEjeX = kEjes.ix[:, 0]
kEjeY = kEjes.ix[:, 1]
# Radio tomado de la mayor distancia de los vecinos más cercanos
#radio = knnDistancia[k-1][1]
# Grafica de los datos normalizados
plt.plot(ejeX, ejeY, 'ro', marker='o', color='r', label="Valores", alpha=0.5) # Datos de la matriz normalizada en rojo
plt.plot(knnDatos[0][listaGrafica[0]], knnDatos[0][listaGrafica[1]], 'bo', marker='o', color='b', label="Valor nuevo") # Nuevo dato en azul
plt.plot(knnDatos[0][listaGrafica[0]], knnDatos[0][listaGrafica[1]], 'bo', marker='o', markersize=100, linewidth=0.5, alpha=0.2) # Área del nuevo dato
plt.plot(kEjeX, kEjeY, 'go', marker='o', color='g', label="Vecinos cerca", alpha=0.5) # Datos de la matriz de vecinos más cercanos en verde
plt.xlabel(etiquetasGrafica[0]) # Etiqueda en el eje X
plt.ylabel(etiquetasGrafica[1]) # Etiqueta en el eje Y
plt.grid(color='b', alpha=0.2, linestyle='dashed', linewidth=0.5) # Malla o grilla
plt.title('KNN, k = ' + str(k)) # Titulo de la gráfica
plt.legend(loc="lower right") # Legenda de la gráfica
plt.show()
def KMEANS():
print("Algoritmo de K-MEANS")
# Se establece la selección de la metrica que se quiere
opcionMetrica = seleccion_metrica()
# Cargar el archivo dataset
dataset = loadDataset()
#print(dataset)
#print(dataset.head())
# Se extrane las columnas del dataset
dataset.columns
print(dataset.columns)
print(dataset.describe()) # Descripción estadistica de los datos
columns = len(dataset.columns) # Número total de columnas
#print(columns)
rows = len(dataset.index) # Número total de filas
#print(rows)
# Agrupando columnas por tipo de datos
tipos = dataset.columns.to_series().groupby(dataset.dtypes).groups
# Armando lista de columnas categóricas
try:
ctext = tipos[np.dtype('object')]
except KeyError:
ctext = list() # lista de columnas vacia en caso de que no haya categóricas
print("\nNúmero de columnas categoricas: " + str(len(ctext))) # cantidad de columnas con datos categóricos
# Armando lista de columnas numéricas
columnas = dataset.columns # lista total las columnas
cnum = list(set(columnas) - set(ctext)) # Total de columnas menos columnas no numéricas
print("Número de columnas numericas: " + str(len(cnum)))
# Lista de medias
#print(dataset.mean())
'''media = list()
for x in range(len(dataset.mean())):
media.append(dataset.mean()[x])
print(media)'''
media = dataset.mean().values.tolist() # Convertir la media del dataset a una lista
print("\nLista de medias: " + str(media))
#print(media)
# Lista de desviación estandar
#print(dataset.std())
'''destandar = list()
for x in range(len(dataset.std())):
destandar.append(dataset.std()[x])
print(destandar)'''
destandar = dataset.std().values.tolist() # Convertir la desviación estandar del dataset a una lista
print("Lista de desviación estandar: " + str(destandar))
#print(destandar)
# Lista de caracteristicas
lcaracteristicas = list()
for x in range(len(cnum)):
lcaracteristicas.append(columnas[x])
print("Lista de características: " + str(lcaracteristicas))
#print(lcaracteristicas)
# Todas las filas y todas las columnas del dataset en una lista
matriz = dataset.loc[:,].values
print("\nMatriz:")
print(matriz)
# Matriz normalizada
matrizNormalizada = list()
MNrow = list()
for x in range(rows):
for y in range(len(cnum)):
result = ((matriz[x][y] - media[y]) / destandar[y])
MNrow.append(result)
matrizNormalizada.append(MNrow)
MNrow = list()
print("\nMatriz normalizada:")
#print(matrizNormalizada) # Matriz con los valores normalizados de los Clusters
MN = pd.DataFrame(np.array(matrizNormalizada)) # Matriz normalizada con pandas
print(MN)
# Matriz de distancia euclidiana
individuo_tabla = list()
lista_metrica = list()
matriz_distancia = list()
for n in range(rows):
individuo = vector_registro_matrizNormalizada(n, matrizNormalizada, len(cnum))
#print(individuo)
for v in range(rows):
for h in range(len(cnum)):
valor = matrizNormalizada[v][h]
individuo_tabla.append(valor)
#print(individuo_tabla)
metrica = seleccion_metrica_distancia(individuo, individuo_tabla, opcionMetrica)
#print(metrica)
lista_metrica.append(metrica)
individuo_tabla = list()
#print(lista_metrica)
matriz_distancia.append(lista_metrica)
lista_metrica = list()
print("\nMatriz de " + str(lista_metricas[opcionMetrica-1]) + ": ")
#print(matriz_distancia)
MD = pd.DataFrame(np.array(matriz_distancia)) # Matriz de distacia con pandas
print(MD)
'''
# Matriz de distancia euclidiana, triangular inferior
triangular_inferior = copy.deepcopy(matriz_distancia) # Copia de la lista
TIrow = list()
for x in range(0,len(triangular_inferior)):
for y in range(x,len(triangular_inferior)):
triangular_inferior[x][y] = 0
print("\nMatriz de distancia euclidiana triangular inferior:")
#print(triangular_inferior)
TI = pd.DataFrame(np.array(triangular_inferior)) # Matriz de distacia triangular inferior con pandas
print(TI)
'''
# Selección de las características para el gráfico
print()
for x in range(len(lcaracteristicas)):
print(str(x+1) + ". " + lcaracteristicas[x])
print("Seleccione dos características para el gráfico de Cluster: ")
# Lista de las caracteristicas seleccionadas
listaGrafica = list()
etiquetasGrafica = list()
for x in range(2):
nCluster = int(input("Característica " + str(x+1) + ": "))
listaGrafica.append(nCluster-1) # Se seleccionan las caracteristicas de la lista de acuerdo al numero ingresado
etiquetasGrafica.append(lcaracteristicas[nCluster-1]) # Etiquetas de los ejes de la gráfica, las características seleccionadas
print("Ejes de la gráfica: " + str(listaGrafica)) # Lista de ejes para la gráfica
print("Etiquetas de la gráfica: " + str(etiquetasGrafica))
# Todas las filas y dos columnas para la gráfica
matrizGrafica = MN.ix[:, [listaGrafica[0], listaGrafica[1]]].values
print("\nMatriz de la gráfica:")
print(matrizGrafica)
# =========================================================================================================================
# Número de cluster
nCluster = int(input("\nIngrese el número de N Clusters: "))
while (nCluster < 1 or nCluster > rows):
nCluster = int(input("El valor de N es incorrecto, debe estar entre 1" + " y " + str(rows) + ": "))
# Selección de los centroides de los Clusters aleatorios y sus indices hasta completar el número de Clusters
ClustersCentroides = list()
ClustersIndices = list()
x = 0
while (x < nCluster):
nRandom = random.randint(0, len(matrizNormalizada)-1)
if nRandom not in ClustersIndices: # Si el nRandom no esta en la lista ClustersIndices no entra
x += 1
ClustersIndices.append(nRandom)
valor = matrizNormalizada[nRandom]
ClustersCentroides.append(valor)
print("\nIndices de los Clusters: " + str(ClustersIndices)) # Indices de los Clusters
print("Centroides de los Clusters: ") # Clusters
print(pd.DataFrame(np.array(ClustersCentroides)))
# Distancia de los Clusters
ClustersDistancias = list()
for x in range(nCluster):
indice = ClustersIndices[x]
ClustersDistancias.append(matriz_distancia[indice])
print("\nDistancia de los Clusters: ")
#print(ClustersDistancias)
CD = pd.DataFrame(np.array(ClustersDistancias)) # Matriz de distacia de los Clusters
print(CD)
#print(CD.describe())
#print(CD.min())
# Lista de mínimos
ClustersMin = CD.min().values.tolist() # Convertir los mínimos de ClustersDistancias a una lista
print("\nLista de mínimos: " + str(ClustersMin))
#print(ClustersMin)
# Lista de Clusters
Clusters = list()
listaMin = list()
for x in range(len(matriz_distancia)):
for y in range(nCluster):
listaMin.append(ClustersDistancias[y][x])
Clusters.append(minimo(listaMin))
listaMin = list()
print("\nLista de Clusters: " + str(Clusters))
# Lista de indices de los Clusters
indices = list()
for x in range(len(Clusters)):
indices.append(x)
# Diccionario de indices: Clusters
ClustersDiccionario = dict(zip(indices, Clusters))
cd = sorted(ClustersDiccionario.items(), key=operator.itemgetter(1)) # Ordena el diccionario en tuplas por el valor (0 = clave, 1 = valor)
print("\nDiccionario valor:Cluster ordenado por Cluster:")
print(cd) # Imprime el diccionario en tuplas ordenado por valor
# Llaves y valores en listas
llaves = list()
valores = list()
for x in range(len(ClustersDiccionario)):
llaves.append(cd[x][0])
valores.append(cd[x][1])
#print(llaves)
#print(valores)
# Diccionario con las claves pero sin valores Clusters:Valores
ClustersDiccionario = {}
for x in range(nCluster):
ClustersDiccionario.setdefault('Cluster'+str(x),)
#print(ClustersDiccionario) # Diccionario vacio
# Diccionario con los Clusters completos
listaClusters = list()
for x in range(nCluster):
for y in range(len(Clusters)):
if valores[y] == x:
listaClusters.append(matrizNormalizada[llaves[y]])
ClustersDiccionario['Cluster'+str(x)] = listaClusters
listaClusters = list()
#print(ClustersDiccionario)
# Diccionario de cada Cluster
for x in range(nCluster):
print("\nCluster " + str(x) + ": " + str(ClustersDiccionario['Cluster'+str(x)]))
# ============================================================================================================================
# SEGUNDA ITERACIÓN
iteraciones = 1
respuesta = False
while (respuesta == False):
# Nuevos centroides del Cluster calculados por la media
mediaClustersNuevosCentroides = list()
for x in range(nCluster):
ClusterNuevo = pd.DataFrame(np.array(ClustersDiccionario['Cluster'+str(x)]))
mcn = ClusterNuevo.mean().values.tolist() # Convertir la media del ClusterX a una lista
mediaClustersNuevosCentroides.append(mcn)
print("\nLista de medias de los Cluster nuevos: ")
print(pd.DataFrame(np.array(mediaClustersNuevosCentroides)))
# Distancia de nuevos centroides
individuo_tabla = list()
lista_metrica = list()
matriz_distancia_cluster = list()
for n in range(nCluster):
for v in range(rows):
for h in range(len(cnum)):
valor = matrizNormalizada[v][h]
individuo_tabla.append(valor)
#print(individuo_tabla)
metrica = seleccion_metrica_distancia(mediaClustersNuevosCentroides[n], individuo_tabla, opcionMetrica)
#print(metrica)
lista_metrica.append(metrica)
individuo_tabla = list()
#print(lista_metrica)
matriz_distancia_cluster.append(lista_metrica)
lista_metrica = list()
print("\nMatriz de " + str(lista_metricas[opcionMetrica-1]) + " de los Cluster nuevos:")
#print(matriz_distancia_cluster)
MDC = pd.DataFrame(np.array(matriz_distancia_cluster)) # Matriz de distacia con pandas
print(MDC)
# Lista de mínimos nuevos
ClustersMinNuevos = MDC.min().values.tolist() # Convertir los mínimos de ClustersMinNuevos a una lista
print("\nLista de mínimos nuevos: " + str(ClustersMinNuevos))
#print(ClustersMin)
# Lista de Clusters nuevos
ClustersNuevos = list()
listaMinNuevos = list()
for x in range(len(matriz_distancia)):
for y in range(nCluster):
listaMinNuevos.append(matriz_distancia_cluster[y][x])
ClustersNuevos.append(minimo(listaMinNuevos))
listaMinNuevos = list()
print("\nLista de Clusters pasada: " + str(Clusters))
print("\nLista de Clusters nuevos: " + str(ClustersNuevos))
# Condición que compara la lista inicial de los Clusters con la lista nueva de los Clusters
if (Clusters == ClustersNuevos):
respuesta = True
else:
respuesta = False
#print(respuesta)
# Lista de indices de los Clusters nuevos
indices = list()
for x in range(len(ClustersNuevos)):
indices.append(x)
# Diccionario de indices: Clusters nuevos
ClustersDiccionarioNuevo = dict(zip(indices, ClustersNuevos))
cdn = sorted(ClustersDiccionarioNuevo.items(), key=operator.itemgetter(1)) # Ordena el diccionario en tuplas por el valor (0 = clave, 1 = valor)
print("\nDiccionario valor:ClusterNuevo ordenado por Cluster:")
print(cdn) # Imprime el diccionario en tuplas ordenado por valor
# Llaves y valores en listas