本篇文章介绍在spark中调用训练好的tensorflow模型进行预测的方法。
本文内容的学习需要一定的spark和scala基础。
如果使用pyspark的话会比较简单,只需要在每个executor上用Python加载模型分别预测就可以了。
但工程上为了性能考虑,通常使用的是scala版本的spark。
本篇文章我们通过TensorFlow for Java 在spark中调用训练好的tensorflow模型。
利用spark的分布式计算能力,从而可以让训练好的tensorflow模型在成百上千的机器上分布式并行执行模型推断。
在spark(scala)中调用tensorflow模型进行预测需要完成以下几个步骤。
(1)准备protobuf模型文件
(2)创建spark(scala)项目,在项目中添加java版本的tensorflow对应的jar包依赖
(3)在spark(scala)项目中driver端加载tensorflow模型调试成功
(4)在spark(scala)项目中通过RDD在executor上加载tensorflow模型调试成功
(5) 在spark(scala)项目中通过DataFrame在executor上加载tensorflow模型调试成功
我们使用tf.keras 训练一个简单的线性回归模型,并保存成protobuf文件。
import tensorflow as tf
from tensorflow.keras import models,layers,optimizers
## 样本数量
n = 800
## 生成测试用数据集
X = tf.random.uniform([n,2],minval=-10,maxval=10)
w0 = tf.constant([[2.0],[-1.0]])
b0 = tf.constant(3.0)
Y = X@w0 + b0 + tf.random.normal([n,1],mean = 0.0,stddev= 2.0) # @表示矩阵乘法,增加正态扰动
## 建立模型
tf.keras.backend.clear_session()
inputs = layers.Input(shape = (2,),name ="inputs") #设置输入名字为inputs
outputs = layers.Dense(1, name = "outputs")(inputs) #设置输出名字为outputs
linear = models.Model(inputs = inputs,outputs = outputs)
linear.summary()
## 使用fit方法进行训练
linear.compile(optimizer="rmsprop",loss="mse",metrics=["mae"])
linear.fit(X,Y,batch_size = 8,epochs = 100)
tf.print("w = ",linear.layers[1].kernel)
tf.print("b = ",linear.layers[1].bias)
## 将模型保存成pb格式文件
export_path = "./data/linear_model/"
version = "1" #后续可以通过版本号进行模型版本迭代与管理
linear.save(export_path+version, save_format="tf")
!ls {export_path+version}
# 查看模型文件相关信息
!saved_model_cli show --dir {export_path+str(version)} --all
模型文件信息中这些标红的部分都是后面有可能会用到的。
如果使用maven管理项目,需要添加如下 jar包依赖
<!-- https://mvnrepository.com/artifact/org.tensorflow/tensorflow -->
<dependency>
<groupId>org.tensorflow</groupId>
<artifactId>tensorflow</artifactId>
<version>1.15.0</version>
</dependency>
也可以从下面网址中直接下载 org.tensorflow.tensorflow的jar包
以及其依赖的org.tensorflow.libtensorflow 和 org.tensorflowlibtensorflow_jni的jar包 放到项目中。
https://mvnrepository.com/artifact/org.tensorflow/tensorflow/1.15.0
我们的示范代码在jupyter notebook中进行演示,需要安装toree以支持spark(scala)。
import scala.collection.mutable.WrappedArray
import org.{tensorflow=>tf}
//注:load函数的第二个参数一般都是“serve”,可以从模型文件相关信息中找到
val bundle = tf.SavedModelBundle
.load("/Users/liangyun/CodeFiles/eat_tensorflow2_in_30_days/data/linear_model/1","serve")
//注:在java版本的tensorflow中还是类似tensorflow1.0中静态计算图的模式,需要建立Session, 指定feed的数据和fetch的结果, 然后 run.
//注:如果有多个数据需要喂入,可以连续使用多个feed方法
//注:输入必须是float类型
val sess = bundle.session()
val x = tf.Tensor.create(Array(Array(1.0f,2.0f),Array(2.0f,3.0f)))
val y = sess.runner().feed("serving_default_inputs:0", x)
.fetch("StatefulPartitionedCall:0").run().get(0)
val result = Array.ofDim[Float](y.shape()(0).toInt,y.shape()(1).toInt)
y.copyTo(result)
if(x != null) x.close()
if(y != null) y.close()
if(sess != null) sess.close()
if(bundle != null) bundle.close()
result
输出如下:
Array(Array(3.019596), Array(3.9878292))
下面我们通过广播机制将Driver端加载的TensorFlow模型传递到各个executor上,并在executor上分布式地调用模型进行推断。
import org.apache.spark.sql.SparkSession
import scala.collection.mutable.WrappedArray
import org.{tensorflow=>tf}
val spark = SparkSession
.builder()
.appName("TfRDD")
.enableHiveSupport()
.getOrCreate()
val sc = spark.sparkContext
//在Driver端加载模型
val bundle = tf.SavedModelBundle
.load("/Users/liangyun/CodeFiles/master_tensorflow2_in_20_hours/data/linear_model/1","serve")
//利用广播将模型发送到executor上
val broads = sc.broadcast(bundle)
//构造数据集
val rdd_data = sc.makeRDD(List(Array(1.0f,2.0f),Array(3.0f,5.0f),Array(6.0f,7.0f),Array(8.0f,3.0f)))
//通过mapPartitions调用模型进行批量推断
val rdd_result = rdd_data.mapPartitions(iter => {
val arr = iter.toArray
val model = broads.value
val sess = model.session()
val x = tf.Tensor.create(arr)
val y = sess.runner().feed("serving_default_inputs:0", x)
.fetch("StatefulPartitionedCall:0").run().get(0)
//将预测结果拷贝到相同shape的Float类型的Array中
val result = Array.ofDim[Float](y.shape()(0).toInt,y.shape()(1).toInt)
y.copyTo(result)
result.iterator
})
rdd_result.take(5)
bundle.close
输出如下:
Array(Array(3.019596), Array(3.9264367), Array(7.8607616), Array(15.974984))
除了可以在Spark的RDD数据上调用tensorflow模型进行分布式推断,
我们也可以在DataFrame数据上调用tensorflow模型进行分布式推断。
主要思路是将推断方法注册成为一个sparkSQL函数。
import org.apache.spark.sql.SparkSession
import scala.collection.mutable.WrappedArray
import org.{tensorflow=>tf}
object TfDataFrame extends Serializable{
def main(args:Array[String]):Unit = {
val spark = SparkSession
.builder()
.appName("TfDataFrame")
.enableHiveSupport()
.getOrCreate()
val sc = spark.sparkContext
import spark.implicits._
val bundle = tf.SavedModelBundle
.load("/Users/liangyun/CodeFiles/master_tensorflow2_in_20_hours/data/linear_model/1","serve")
val broads = sc.broadcast(bundle)
//构造预测函数,并将其注册成sparkSQL的udf
val tfpredict = (features:WrappedArray[Float]) => {
val bund = broads.value
val sess = bund.session()
val x = tf.Tensor.create(Array(features.toArray))
val y = sess.runner().feed("serving_default_inputs:0", x)
.fetch("StatefulPartitionedCall:0").run().get(0)
val result = Array.ofDim[Float](y.shape()(0).toInt,y.shape()(1).toInt)
y.copyTo(result)
val y_pred = result(0)(0)
y_pred
}
spark.udf.register("tfpredict",tfpredict)
//构造DataFrame数据集,将features放到一列中
val dfdata = sc.parallelize(List(Array(1.0f,2.0f),Array(3.0f,5.0f),Array(7.0f,8.0f))).toDF("features")
dfdata.show
//调用sparkSQL预测函数,增加一个新的列作为y_preds
val dfresult = dfdata.selectExpr("features","tfpredict(features) as y_preds")
dfresult.show
bundle.close
}
}
TfDataFrame.main(Array())
+----------+
| features|
+----------+
|[1.0, 2.0]|
|[3.0, 5.0]|
|[7.0, 8.0]|
+----------+
+----------+---------+
| features| y_preds|
+----------+---------+
|[1.0, 2.0]| 3.019596|
|[3.0, 5.0]|3.9264367|
|[7.0, 8.0]| 8.828995|
+----------+---------+
以上我们分别在spark 的RDD数据结构和DataFrame数据结构上实现了调用一个tf.keras实现的线性回归模型进行分布式模型推断。
在本例基础上稍作修改则可以用spark调用训练好的各种复杂的神经网络模型进行分布式模型推断。
但实际上tensorflow并不仅仅适合实现神经网络,其底层的计算图语言可以表达各种数值计算过程。
利用其丰富的低阶API,我们可以在tensorflow2.0上实现任意机器学习模型,
结合tf.Module提供的便捷的封装功能,我们可以将训练好的任意机器学习模型导出成模型文件并在spark上分布式调用执行。
这无疑为我们的工程应用提供了巨大的想象空间。
如果对本书内容理解上有需要进一步和作者交流的地方,欢迎在公众号"Python与算法之美"下留言。作者时间和精力有限,会酌情予以回复。
也可以在公众号后台回复关键字:加群,加入读者交流群和大家讨论。