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@AIFFEL-GUACAMole

AIFFEL-GUACAMole

GUACAMole 🧬

Graph Unified Attention-based Chemical Analysis of Molecules

🎯 Project Goal

Cross-modal molecule representation model을 통한 ADMET/toxicity 예측 시스템 개발

주요 목표

  • 분자 구조의 특성을 효과적으로 포착할 수 있는 robust representation 개발
  • CYP 주요 isoform 억제 예측 (binary classification) SOTA 달성
  • hERG blocker 예측 (binary classification) SOTA 달성

부가 목표

  • 기타 ADMET property, toxicity property prediction task에서 SOTA 달성
  • Quantum-mechanics task에서 준수한 성능 달성
  • 예측 결과에 대한 설명 가능한 해석 방법 구현

🔍 Key Features

  • 여러 모달리티(2D, 3D, 텍스트 등)를 합성하여 분자 표현을 강건하게 구성
  • 기존 모델 대비 향상된 성능의 ADMET 예측
  • 산업계 활용 가능한 실용적인 시스템 구현

🛠 Tech Stack

  • Pre-training Data: PubChem, ZINC15/20, ChemBL, PCQM4Mv2
  • Fine-tuning Data: TDC, MoleculeNet, Polaris
  • Deep Learning Framework: PyTorch
  • Key Technologies: GNN, Transformer, Multi-modal Learning

👥 Team Members

  • 양기택
  • 김종환
  • 윤철희
  • 홍사빈

📅 Project Timeline (2024.12 ~ 2025.02)

  1. Model 조사 및 구현 (1-4주차)
  2. Model 고도화 및 성능 개선 (4-6주차)
    • TDC leaderboard 도전
    • Polaris competition 도전
    • Aigen Dataset validation
  3. 최종 발표 및 서비스 배포 (7주차)

🤝 In Collaboration with

AIGEN Sciences - Harnessing AI for Real-World Drug Discovery


© 2024 GUACAMole Team. All Rights Reserved.

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