DGInHouse

DGInHous visa automatizar as análises de Root-mean-square deviation of atomic positions (RMSD) e Raio de Giro (RG), e realizar cálculos de Energia Livre, representando graficamente a superfície de energia (figura 1 e 2) comparativos entre dois sistemas (ex.: apo e holo). Podendo ser útil em estudos de interação Proteína-Proteína ou Proteína-Ligante, enovelamento proteico, mutações, dentre outros. 

Utilização

python3 main.py -data_a caminho_data_a -data_b caminho_data_b

Opções de comandos

• -data_a ou -data_b: arquivo contendo valores de RG e RMSD;
• -cor_a ou -cor_b: arquivo de coordenada da simulação (pdb, .gro, etc);
• -top_a ou -top_b: arquivo de topologia da simulação (.psf)
• -traj_a ou -traj_b: trajetória da Dinâmica Molecular;
• -path: local para salvar dados e/ou gráfico;
• -show_grafic: mostrar gráfico na janela;
• -save_fig: salva figura no caminho definido;
• -save_data: salva valores de RMSD, RG e DG;

Figura 1: Gráfico 3D RMSD, RG e Energia Livre
Figura 1: Gráfico 2D RMSD, RG e Energia Livre